保護區等效連通性指標（ProtConn）透過量化保護區之間的功能性連結，反映生態網絡支持物種移動與區域族群重建的能力。本指標採用圖論（Graph Theory）架構，將保護區視為網絡中的「節點」，評估不同播遷能力的物種，於保護區網絡中隨機移動的機率。 最新分析顯示，臺灣法定保護區目前約占國土 19.4%，其中具備連通性者達 17.9%。研究指出，單純增加法定保護區面積對提升連通性效益有限。然而，若納入國土生態綠網與保育共生地（OECM），整體連通性可望由 17.9% 大幅提升至 55% 以上，顯示綠網在補強低海拔破碎地景、達成昆蒙框架「30×30」目標中扮演關鍵角色。
